MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TTGT	2	8	3928	3935	0 %	75 %	25 %	0 %	240111941
2	NC_012807	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111941
3	NC_012807	GC	3	6	4225	4230	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
4	NC_012807	TGG	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
5	NC_012807	CGT	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
6	NC_012807	CGC	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
7	NC_012807	CGC	2	6	4376	4381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
8	NC_012807	CGA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
9	NC_012807	GC	3	6	4480	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
10	NC_012807	TCCCC	2	10	4506	4515	0 %	20 %	0 %	80 %	240111942
11	NC_012807	GCT	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
12	NC_012807	CCG	2	6	4642	4647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
13	NC_012807	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
14	NC_012807	CCG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
15	NC_012807	CGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
16	NC_012807	GAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
17	NC_012807	TCG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
18	NC_012807	GCT	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
19	NC_012807	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
20	NC_012807	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
21	NC_012807	GC	3	6	4981	4986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
22	NC_012807	GCA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
23	NC_012807	GCC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
24	NC_012807	GTG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
25	NC_012807	AGG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111942
26	NC_012807	C	6	6	5091	5096	0 %	0 %	0 %	100 %	240111942
27	NC_012807	GCC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
28	NC_012807	TTC	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
29	NC_012807	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240111942
30	NC_012807	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
31	NC_012807	TGCA	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	240111943
32	NC_012807	CA	3	6	5834	5839	50 %	0 %	0 %	50 %	240111943
33	NC_012807	CCT	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111943
34	NC_012807	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
35	NC_012807	GC	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	240111943
36	NC_012807	GTC	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
37	NC_012807	GCG	2	6	6015	6020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
38	NC_012807	CCG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
39	NC_012807	CTG	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
40	NC_012807	GCC	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
41	NC_012807	GCG	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
42	NC_012807	GAT	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111943
43	NC_012807	GGCG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	75 %	25 %	240111943
44	NC_012807	CGT	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
45	NC_012807	TCCA	2	8	6290	6297	25 %	25 %	0 %	50 %	240111943
46	NC_012807	TCT	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111943
47	NC_012807	GGT	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111943
48	NC_012807	GAT	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111943
49	NC_012807	TCG	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
50	NC_012807	AGCC	2	8	6911	6918	25 %	0 %	25 %	50 %	240111944
51	NC_012807	CG	3	6	6940	6945	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
52	NC_012807	CGGCCT	2	12	6951	6962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240111944
53	NC_012807	GAG	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111944
54	NC_012807	GCC	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
55	NC_012807	GGCG	2	8	7050	7057	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
56	NC_012807	CCA	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111944
57	NC_012807	GCT	2	6	7161	7166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
58	NC_012807	GAG	2	6	7201	7206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111944
59	NC_012807	GCCTCC	2	12	7325	7336	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	240111944
60	NC_012807	CCGG	2	8	7342	7349	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
61	NC_012807	CCGC	2	8	7389	7396	0 %	0 %	25 %	75 %	240111944
62	NC_012807	GAC	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
63	NC_012807	CCGG	2	8	7458	7465	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
64	NC_012807	CGC	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
65	NC_012807	CAGGG	2	10	7531	7540	20 %	0 %	60 %	20 %	240111944
66	NC_012807	GCG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
67	NC_012807	TCCT	2	8	7616	7623	0 %	50 %	0 %	50 %	240111944
68	NC_012807	CGC	2	6	7628	7633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
69	NC_012807	CCG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
70	NC_012807	GC	4	8	7706	7713	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
71	NC_012807	CGC	2	6	7762	7767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
72	NC_012807	CGC	2	6	7838	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
73	NC_012807	CCCAGC	2	12	7956	7967	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	240111944
74	NC_012807	GCG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
75	NC_012807	TCT	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111944
76	NC_012807	GGTCGG	2	12	8028	8039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	240111944
77	NC_012807	TCG	3	9	8057	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
78	NC_012807	GC	4	8	8166	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
79	NC_012807	GCT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
80	NC_012807	CCT	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111944
81	NC_012807	GTC	2	6	8239	8244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
82	NC_012807	TCGC	2	8	8282	8289	0 %	25 %	25 %	50 %	240111944
83	NC_012807	GGGC	2	8	8307	8314	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
84	NC_012807	CGG	2	6	8319	8324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
85	NC_012807	GCT	2	6	8337	8342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
86	NC_012807	CGT	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
87	NC_012807	GCG	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
88	NC_012807	TCG	2	6	8429	8434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111944
89	NC_012807	CGC	2	6	8450	8455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
90	NC_012807	GCC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
91	NC_012807	CGGC	2	8	8531	8538	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
92	NC_012807	GCG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
93	NC_012807	CGA	2	6	8580	8585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
94	NC_012807	ACG	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111944
95	NC_012807	CGC	3	9	8670	8678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111944
96	NC_012807	GCG	2	6	8689	8694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
97	NC_012807	GCG	2	6	8750	8755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111944
98	NC_012807	GCGGGG	2	12	8768	8779	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	240111944
99	NC_012807	GCC	2	6	8858	8863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
100	NC_012807	GCG	2	6	8867	8872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
101	NC_012807	GCG	2	6	8894	8899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
102	NC_012807	GGA	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111945
103	NC_012807	GC	3	6	8981	8986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
104	NC_012807	GCG	2	6	8999	9004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
105	NC_012807	GGC	2	6	9058	9063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
106	NC_012807	CGG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
107	NC_012807	TCG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111945
108	NC_012807	TAG	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111945
109	NC_012807	GGC	2	6	9265	9270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111945
110	NC_012807	GCA	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111945
111	NC_012807	GCCGG	2	10	9383	9392	0 %	0 %	60 %	40 %	240111945
112	NC_012807	CGTC	2	8	9405	9412	0 %	25 %	25 %	50 %	240111945
113	NC_012807	CGGG	2	8	9414	9421	0 %	0 %	75 %	25 %	240111945
114	NC_012807	CTC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111945
115	NC_012807	GTC	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111945
116	NC_012807	GAC	2	6	9556	9561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111945
117	NC_012807	CGC	2	6	9576	9581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
118	NC_012807	C	6	6	9592	9597	0 %	0 %	0 %	100 %	240111945
119	NC_012807	CCAG	2	8	9660	9667	25 %	0 %	25 %	50 %	240111945
120	NC_012807	CGC	2	6	9744	9749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
121	NC_012807	CAC	2	6	9761	9766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111945
122	NC_012807	GTG	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111945
123	NC_012807	GC	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
124	NC_012807	CGC	3	9	9841	9849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111945
125	NC_012807	GAG	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111946
126	NC_012807	CGG	2	6	10349	10354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
127	NC_012807	CAG	2	6	10442	10447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111946
128	NC_012807	CGG	2	6	10486	10491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
129	NC_012807	GCG	2	6	10494	10499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111946
130	NC_012807	TGG	2	6	10500	10505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111946
131	NC_012807	GGA	2	6	10513	10518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111946
132	NC_012807	ACG	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111946
133	NC_012807	GCGG	2	8	10564	10571	0 %	0 %	75 %	25 %	240111946
134	NC_012807	TGC	2	6	10578	10583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111946
135	NC_012807	AAG	3	9	10592	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240111946
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142	NC_012807	TCG	2	6	10962	10967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111947
143	NC_012807	GCC	2	6	10968	10973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111947
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145	NC_012807	TCACA	2	10	11101	11110	40 %	20 %	0 %	40 %	240111948
146	NC_012807	GCAG	2	8	11186	11193	25 %	0 %	50 %	25 %	240111948
147	NC_012807	CG	3	6	11252	11257	0 %	0 %	50 %	50 %	240111948
148	NC_012807	ACC	2	6	11287	11292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111948
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262	NC_012807	CTC	2	6	17249	17254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111957
263	NC_012807	GTC	2	6	17276	17281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111957
264	NC_012807	CAG	2	6	17336	17341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111957
265	NC_012807	TCC	2	6	17400	17405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111957
266	NC_012807	GGC	2	6	17460	17465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111957
267	NC_012807	CCG	2	6	17473	17478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111957
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270	NC_012807	TTC	2	6	17616	17621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111957
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272	NC_012807	GTCGC	2	10	17653	17662	0 %	20 %	40 %	40 %	240111957
273	NC_012807	GC	3	6	17692	17697	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
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282	NC_012807	CGA	2	6	18103	18108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111957
283	NC_012807	TCA	2	6	18136	18141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240111957
284	NC_012807	ATC	3	9	18183	18191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240111957
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289	NC_012807	CGA	2	6	18316	18321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111957
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389	NC_012807	CGA	2	6	22548	22553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111961
390	NC_012807	CCGG	2	8	22554	22561	0 %	0 %	50 %	50 %	240111961
391	NC_012807	GGCT	2	8	22624	22631	0 %	25 %	50 %	25 %	240111961
392	NC_012807	CGG	2	6	22671	22676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111961
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403	NC_012807	TGC	2	6	23016	23021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111962
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500	NC_012807	CTT	2	6	27537	27542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111968

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